Dörpinghaus, J: Java für die Life Sciences

1. Auflage 2020
ISBN: 978-3-96009-125-7
Verlag: Dpunkt.Verlag GmbH

Buch, Deutsch, 252 Seiten, Format (B × H): 165 mm x 240 mm

Reihe: Animals

Lernen Sie grundlegende Java-Techniken, die für die Auswertung von Biodaten benötigt werdenEine Einführung in Java für Biowissenschaftler mit ProgrammiererfahrungBietet biologische Hintergrundinformationen, soweit sie zum Verständnis des Problems hilfreich sindMit zahlreichen Übungsaufgaben und Codebeispielen
Diese Einführung in die angewandte Bioinformatik mit Java vermittelt Ihnen grundlegende Java-Techniken, die für die Analyse von Daten in den Life Sciences benötigt werden. Das Buch richtet sich an Studenten, Wissenschaftler und Praktiker mit Grundkenntnissen in einer höheren Programmiersprache. Es bietet Ihnen einen fundierten Einstieg in die Kernthemen der Programmierung in den Life Sciences.
Aussagekräftige Beispiele aus der Bioinformatik illustrieren alle notwendigen Schritte, damit Sie in kurzer Zeit Ergebnisse mit Java erzielen können. Biologische Zusammenhänge werden immer dann beschrieben, wenn sie zum Verständnis des Problems hilfreich sind. Anhand der zahlreichen Praxisprojekte und Übungsaufgaben lernen Sie, Ihre eigenen, gut durchdachten Softwarelösungen zu schreiben.

Themen des Buchs:Die Java-Arbeitsumgebung: Installation und Einrichten von JDK, Eclipse, Git und MavenJava zum Auffrischen: Programmierkonzepte wie Variablen, Arrays und Schleifen sowie objektorientiertes ProgrammierenData Engineering: Workflows für den Data Lifecycle, die Arbeit mit XML, JSON, SQL, API-Schnittstellen und BASHData Mining: Methoden der Klassifizierung und des Clusterings wie Binning, Hashing, statistische Modelle und K-MeansNetzwerkanalyse: Einführung in die Bibliothek JGraphT, Graphen als Methode zur Darstellung biologischer ProzesseBildverarbeitung: die Arbeit mit ImageJ für Partikelanalyse, Objektklassifizierung und FarbanalyseSequenzanalyse: die Bibliothek BioJava, Sequence Alignment, BLAST und Next-Generation Sequencing

Zielgruppe

- Student*innen der Biologie, Life Sciences, Bioinformatik, Informatik, Naturwissenschaften
- Praktiker*innen, die Biodaten auswerten

Autoren/Hrsg.

Dörpinghaus, Jens

Schaaf, Sebastian

Weil, Vera

Weil, Vera Sharon

Fachgebiete

• Mathematik | Informatik EDV | Informatik Angewandte Informatik Bioinformatik
• Mathematik | Informatik EDV | Informatik Programmierung | Softwareentwicklung Programmier- und Skriptsprachen
• Naturwissenschaften Biowissenschaften Angewandte Biologie Bioinformatik

Über Autor(innen)

Dörpinghaus, Jens
Jens Dörpinghaus ist Diplom- Mathematiker und promovierter Informatiker. Er arbeitet als Senior Scientist am Deutschen Zentrum für neurodegenerative Erkrankungen (DZNE) in Bonn und unterrichtet unter anderem an der Universität Bonn Life Science Informatics.

Schaaf, Sebastian
Sebastian Schaaf ist promovierter Bioinformatiker. Er arbeitet als Postdoc am Fraunhofer-Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen (SCAI) und unterrichtet an der Universität Bonn im Studiengang Life Science Informatics.

Weil, Vera
Vera Weil ist Diplom-Mathematikerin und hat in der Informatik promoviert. Sie war als Postdoc an der RWTH Aachen tätig und lehrt derzeit an
der Universität zu Köln im Fach Informatik schwerpunktmäßig das Programmieren mit Java.